Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms