Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATL2Q8NHH9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms