Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms