Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms