Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFRP1Q8N474 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms