Protein–RNA interactions for Protein: Q8N268

C20orf197, Uncharacterized protein C20orf197, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf197Q8N268 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C20orf197Q8N268 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms