Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDKL3Q8IVW4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms