Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHA9Q7RTU4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms