Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms