Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM5Q71RC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms