Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CFAP47Q6ZTR5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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