Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC129Q6ZRS4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms