Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD1Q6UXZ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD1Q6UXZ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms