Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VSTM1Q6UX27 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VSTM1Q6UX27 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms