Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC4A10Q6U841 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms