Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VIRMAQ69YN4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VIRMAQ69YN4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms