Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CLQ60I27 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms