Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PERM1Q5SV97 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms