Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms