Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITRM1Q5JRX3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms