Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms