Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERC4Q5GLZ8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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