Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms