Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM259Q4ZIN3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms