Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCGF3Q3KNV8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms