Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDRF1Q3B7T1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EDRF1Q3B7T1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms