Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RRN3P1Q2M238 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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RRN3P1Q2M238 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RRN3P1Q2M238 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RRN3P1Q2M238 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RRN3P1Q2M238 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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RRN3P1Q2M238 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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