Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC142Q17RM4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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