Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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