Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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