Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NRF1Q16656 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NRF1Q16656 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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