Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACKR1Q16570 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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