Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CARTPTQ16568 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms