Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA4Q16363 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms