Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITSN1Q15811 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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