Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPEGQ15772 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms