Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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EFNB3Q15768 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EFNB3Q15768 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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