Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SS18Q15532 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SS18Q15532 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SS18Q15532 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SS18Q15532 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SS18Q15532 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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