Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABEP1Q15276 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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