Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDGFRLQ15198 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDGFRLQ15198 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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