Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SMCO1Q147U7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SMCO1Q147U7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SMCO1Q147U7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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SMCO1Q147U7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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SMCO1Q147U7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMCO1Q147U7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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