Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMC1AQ14683 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMC1AQ14683 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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