Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HNF4GQ14541 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms