Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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