Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms