Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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