Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NCOA4Q13772 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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NCOA4Q13772 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NCOA4Q13772 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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