Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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CUL3Q13618 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUL3Q13618 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUL3Q13618 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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