Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BFSP2Q13515 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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