Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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